Title Epidemiološka i klinička obilježja infekcija dišnog sustava dječje dobi s dokazanim humanim bokavirusom
Title (english) Epidemiological and clinical characteristics of acute respiratory infections in hospitalized children positive for human bocavirus
Author Maja Mijač
Mentor Sunčanica Ljubin Sternak (mentor)
Committee member Nataša Beader (predsjednik povjerenstva)
Committee member Rok Čivljak (član povjerenstva)
Committee member Ana Budimir (član povjerenstva)
Granter University of Zagreb School of Medicine Zagreb
Defense date and country 2024-07-10, Croatia
Scientific / art field, discipline and subdiscipline BIOMEDICINE AND HEALTHCARE Public Health and Health Care Epidemiology
Universal decimal classification (UDC ) 614 - Public health and hygiene. Accident prevention
Abstract Uvod i svrha rada: Cilj ovog istraživanja bio je istražiti epidemiološka i klinička obilježja akutnih respiratornih infekcija (ARI) u hospitalizirane djece kod koje je detektiran humani bokavirus (HBoV). Specifični ciljevi obuhvaćali su određivanje prevalencije HBoV, učestalost monodetekcije i kodetekcije s drugim respiratornim virusima, sezonsku pojavnost HBoV infekcije, kliničku prezentaciju i genotipizaciju izoliranih sojeva. Dalje, cilj je bio odrediti koncentraciju HBoV u nazofaringealnom
... More sekretu oboljelih te ispitati postoji li povezanost između visoke koncentracije HBoV u uzorku i kliničke prezentacije i težine bolesti, potrebe za liječenjem nadoknadom kisika zbog razvoja respiratorne insuficijencije te duljine trajanja hospitalizacije u djece s dokazanim HBoV.
Materijali i metode: Istraživanje je provedeno u Klinici za dječje bolesti Zagreb i Općoj bolnici Karlovac u razdoblju od 2017. do 2021. godine. Ispitanici su bila djeca hospitalizirana zbog akutne respiratorne infekcije pretpostavljene virusne etiologije, kojima su uzeti uzorci obriska nazofarinksa i ždrijela. Učinjen je multipleks PCR na 15 respiratornih virusa, a za uzorke pozitivne na HBoV proveden je kvantitativni PCR. Za svakog ispitanika prikupljeni su demografski i klinički podaci. Uzorci u kojima je HBoV otkriven zajedno s drugim virusom dalje su istraženi primjenom MT-PCR-a te su rezultati MT-PCR-a uspoređeni s kvantitativnim PCR-om na HBoV. Genotipizacija izoliranih sojeva HBoV provedena je NGS metodom.
Rezultati: Od 957 testirane djece, HBoV je dokazan u 73 ispitanika te prevalencija ovog virusa u djece hospitalizirane zbog ARI iznosi 7,6 %. U preko 80 % slučajeva virus je dokazan u kombinaciji s drugim respiratornim virusom, najčešće s humanim rinovirusom. Virus je najčešće detektiran u djece od jedne do tri godine s vrhunem pojavnosti u zimskim mjesecima. Klinički se HBoV infekcija prezentirala kao infekcija gornjeg respiratornog sustava (IGDS) u 41,1 % djece, dok je 59,9 % djece s dokazanim HBoV razvilo infekciju donjeg dišnog sustava (IDDS). U slučajevima gdje je HBoV bio jedini dokazani patogen, koncentracije virusa su bile značajno više u nazofaringealnim sekretima djece koja su razvila IDDS u odnosu na na djecu s IGDS (p=0,016). Djeca koja su liječena nadoknadom kisika su imala veću koncentraciju HBoV u uzorcima u odnosu na djecu koja nisu trebala kisik (p=0,022), kao i ona koja su primala empirijsku antimikrobnu terapiju (p=0,049) ili imali predliježeće bolesti (p=0,017). Nije jednoznačno dokazana povezanost duljine hospitalizacije s količinom HBoV. Usporedbom kvantitativnog PCR-a i MT-PCR metode pokazana je podudarnost rezultata ovih dviju metoda, a Pearsonov koeficijent je iznosio 0,939. Genotipizacijom je dokazano da su svi sojevi pripadali HBoV 1 genotipu.
Zaključak: Učestalost HBoV u djece mlađe od 18 godina hospitalizirane zbog akutne respiratorne infekcije u okvirima je pojavnosti HBoV na globalnoj razini. U odnosu na RSV i humani rinovirus, HBoV inficira djecu starije dobi, a vrhunac pojavnosti ovog virusa pada u drugu godinu djetetova života. Pojavnost HBoV slijedi obrazac sezonstva karakterističan i za druge respiratorne viruse, s vrhuncem od studenog do ožujka. Djeca s većom koncentracijom virusa u nazofaringealnim sekretima češće imaju težu kliničku sliku. Usporedbom kvantitativnog PCR-a i MT-PCR metode, pokazali smo da se MT-PCR metoda može korisiti kao alternativa klasičnom kvantitativnom PCR-u za određivanje količine HBoV. Less
Abstract (english) Introduction and aim: The goal of this research was to investigate the epidemiological and clinical characteristics of acute respiratory infection (ARI) in hospitalized children with proven HBoV and to compare concentration of HBoV with clinical presentation of infection.
Material and methods: The research was conducted among children hospitalized for ARI in two institutions in northwest Croatia over a four-year period. Samples were analysed using multiplex PCR for 15 respiratory viruses,
... More quantitative PCR for HBoV and MT-PCR. Clinical and demographic dana were collected. The genotyping of isolated strains was performed using the NGS method.
Results: The prevalence of HBoV was 7,6%. In cases of monodetection, HBoV was significantly more frequently present in high concentration in children with LRTI compared to children with URTI (p=0,016). Children receiving oxygen supplementation had a higher HBoV concentration in the sample (p=0,022), as well as children receiving empirical antibiotic therapy (p=0,01) and children with underlying diseases (p=0,017), respectively.
Conclusion: High concentration of HBoV was linked to more severe presentation of infection. MT-PCR method can be used as an alternative to classical quantitative PCR for HBoV. Less
Keywords
Dijete
Multipleksna lančana reakcija polimeraze
Prevalencija
Hrvatska
Genotip
Virusi
Infekcije respiratornog trakta
Inhalacijska terapija kisikom
Antibakterijska sredstva
Keywords (english)
Child
Multiplex Polymerase Chain Reaction
Prevalence
Croatia
Genotype
Viruses
Respiratory Tract Infections
Oxygen Inhalation Therapy
Anti-Bacterial Agents
Language croatian
URN:NBN urn:nbn:hr:105:500691
Project Number: IP-2016-06-7556 Title: NOVI I ZAPOSTAVLJENI VIRUSNI UZROČNICI INFEKCIJA DIŠNOG SUSTAVA U VULNERABILNIM SKUPINAMA BOLESNIKA Acronym: RESPIVIRUS Leader: Sunčanica Ljubin Sternak Jurisdiction: Croatia Funder: Hrvatska zaklada za znanost Funding stream: Research Projects
Study programme Title: Biomedicine and Health Sciences Study programme type: university Study level: postgraduate Academic / professional title: doktor/doktorica znanosti, područje biomedicine i zdravstvo (doktor/doktorica znanosti, područje biomedicine i zdravstvo)
Type of resource Text
Extent 111 str.
File origin Born digital
Access conditions Open access
Terms of use
Created on 2024-07-15 10:32:55