Title Distribucija rotavirusnih genotipova u trima regijama u Republici Hrvatskoj Title (english) Distribution of rotavirus genotypes in three regions in Republic of Croatia Author Maja Vrdoljak Pažur Mentor Goran Tešović (mentor)Committee member Jurica Vuković (predsjednik povjerenstva)Committee member Dalibor Vukelić (član povjerenstva)Committee member Sunčanica Ljubin Sternak (član povjerenstva)Granter University of Zagreb Defense date and country 2024-01-05, Croatia Scientific / art field, BIOMEDICINE AND HEALTHCARE Universal decimal classificationUDC ) 616 - Pathology. Clinical medicine Abstract Cilj istraživanja: Glavni cilj istraživanja bio je uvid u epidemiologiju rotavirusnih genotipova koji uzrokuju akutni gastroenteritis u djece mlađe od 5 godina u trima regijama u Republici Hrvatskoj (Središnja, Sjeverna i Južna Hrvatska). Specifični ciljevi obuhvaćali su određivanje udjela pojedinih genotipova, analizu mogućih geografskih, dobnih i sezonskih razlika u distribuciji rotavirusnih genotipova, kao i analizu razlika u distribuciji genotipova između nozokomijalnih i domicilnih rotavirusnih infekcija. Također je procijenjena težina kliničke slike rotavirusnog gastroenteritisa pomoću Vesikarijeve i Clarkove ocjenske ljestvice za stupnjevanje težine bolesti te su analizirane moguće razlike u težini kliničke slike između pojedinih genotipova.
Ispitanici i metode: U istraživanje su uključena djeca mlađa od 5 g. s dijagnozom akutnog gastroenteritisa, liječena u tri hrvatske bolnice (Klinika za infektivne bolesti „Dr. Fran Mihaljević“ u Zagrebu, Klinički bolnički centar Split i Županijska bolnica Čakovec) tijekom dvije godine (srpanj 2012.- srpanj 2014.g.). Prikupljeni su demografski i klinički podaci te je učinjena imunokromatografska analiza stolice na Rotavirus i Adenovirus. Svi imunokromatografski rotavirus pozitivni uzorci dalje su analizirani (lančana reakcija polimerazom i sekvenciranje) radi određivanja genotipa rotavirusa. Na temelju prikupljenih kliničkih podataka izračunata je težina kliničke slike pomoću Vesikarijeve i Clarkove ocjenske ljestvice.
Rezultati: Među 822 genotipizirana rotavirusna uzorka udio globalno „čestih“ genotipskih kombinacija (G1P[8], G2P[4], G3P[8], G4P[8] i G9P[8]) bio je gotovo 89% ukupno te 81-95% među regijama. Najčešći genotip bio je G1P[8], ukupno (62%) i u svim regijama (57%, 64% i 77%). Prevalencija humano-humanih reasortanata bila je visoka (gotovo 8%), a G6 tip prvi put je opisan u Hrvatskoj. Nije bilo dobne razlike u distribuciji genotipova. Rotavirusna infekcija imala je izraženo sezonstvo u zimskim i ranim proljetnim mjesecima, a udio G1[P8], G2[P4] i G9[P8] mijenjao se u sezoni i izvan sezone. Vesikarijeva ocjenska ljestvica značajno je veći udio ispitanika svrstavala u skupinu teškog RVGE. Genotip G2P[8] bio je povezan s većim rizikom za teži tijek bolesti u odnosu na druge genotipove. Domicilni RVGE imali su teži tijek u odnosu na bolničke RVGE. Djeca starija od 12 mjeseci imala su veći rizik za teži tijek RVGE u odnosu na mlađe od 12 mjeseci.
Zaključak: Rezultati ovog istraživanja predstavljaju prevakcinalne podatke bitne za odluku o uvođenju rotavirusnog cjepiva u nacionalni imunizacijski program u Hrvatskoj. Distribucija rotavirusnih genotipova u Hrvatskoj slična je distribuciji u drugim razvijenim zemljama u prevakcinalnom razdoblju, s visokom prevalencijom globalno „čestih“ genotipova koji bi najvećim dijelom bili „pokriveni“ trenutno dostupnim cjepivima u Europi. Međutim, potrebna su daljnja istraživanja i nadzor nad cirkulirajućim rotavirusnim genotipovima da bi se detektirale eventualne promjene u prevalenciji ili pojava novih genotipova.
Abstract (english) Aims: The general aim was to describe epidemiology of rotavirus genotypes in children <5 years in three Croatian regions. Specific aims were to determine prevalence of specific genotypes, possible geographical, age-dependent or seasonal differences in genotype distribution and to assess disease severity using Vesikari and Clark scales.
Patients and methods: The study was conducted among children <5 years with acute gastroenteritis from July 2012 to July 2014 at three hospitals in different Croatian geographical regions. Rotavirus was detected in stools using an immunocromatographic assay, followed by further molecular analysis. Clinical data were collected to calculate Vesikari and Clark scores.
Results: Genotyping of 822 rotaviruses showed that the predominant circulating strain was G1P[8], followed by G2P[4], G1P[4] and G3P[8]. There were significant geographical and seasonal, but no age-dependent differences in genotype distribution. Vesikari and Clark scoring systems varied greately in categorization of severe disease. Genotype G2P[8], age >12 months and community-acquired rotavirus infections were associated with more severe disease.
Conclusions: This study represents pre-vaccination data that are important for decisions regarding immunization strategies in Croatia. High prevalence of „common“ rotavirus strains may advocate for rotavirus vaccine introduction, but further surveillance is necessary to monitor possible emergence of novel genotypes.
Keywords
Ljudi
Dijete
Dijete
Predškolski
Dječji
Rotavirus
Rotavirusne infekcije
Cjepiva protiv rotavirusa
Hrvatska
Genotip
Prevalencija
Godišnja doba
Gastroenteritis
Bolnice
Cijepljenje
Imunizacija
Keywords (english)
Humans
Child
Child
Preschool
Infant
Rotavirus
Rotavirus Infections
Rotavirus Vaccines
Croatia
Genotype
Prevalence
Seasons
Gastroenteritis
Hospitals
Vaccination
Immunization
Language croatian URN:NBN urn:nbn:hr:105:335671 Study programme Title: Biomedicine and Health Sciences Type of resource Text Extent 109 str. File origin Born digital Access conditions Open access Terms of use Created on 2024-01-18 08:16:21
